Terroristik guruh Haqqoniy Network 2004-2005 yillarda Afg'oniston va Pokistonda faoliyat yuritgan razvedka idoralarining hisobotlarida paydo bo'la boshladi. Tarmoq nomi sovet qo'shinlariga qarshi kurashgan dala qo'mondoni Jaloliddin Xoqaniy nomi bilan bog'liq.
Sovet qo'shinlarining Afg'onistonda bo'lgan davrida Jaloluddin Xoqoniy taniqli dala qo'mondoni bo'lgan, uni AQSh Markaziy razvedka boshqarmasi qo'llab-quvvatlagan va moliyaviy yordam ko'rsatgan.
Sovet qo'shinlari chiqarilgandan so'ng Afg'onistonda fuqarolar urushi davom etdi. Haqqoniy bir necha yirik operatsiyalarda qatnashgan, uning obro'si sezilarli darajada oshgan. 1992 yilda u urushayotgan tomonlar o'rtasida tinchlik muzokaralarida qatnashdi, so'ng Afg'oniston Adliya vaziri bo'ldi va to'rt yil davomida ushbu lavozimda ishladi.
1996 yilda Kobulni toliblar qo'lga kiritgandan so'ng, Xoqoniy ular tomonga o'tib ketdi va Chegara ishlari vaziri etib tayinlandi. Amalda, bu uning amerikaliklar tomonidan keyinchalik yo'q qilingan al-Qoida o'quv lagerlari joylashgan Paktiya viloyatini to'liq nazorat qilishiga olib keldi. AQShning Tolibonga qarshi operatsiyasi boshlangandan so'ng Xoqoniy o'z qurolli kuchlariga qo'mondonlik qila boshladi, ammo bosqinchilarga qarshi tura olmadi. Toliblar mag'lubiyatga uchradi, Xoqoniy partizan urushini boshladi va tez orada amerikaliklar Tolibonning eng ko'p qidirilayotgan olti terrorchisidan biri sifatida nomlanishdi.
Xoqanining hukumat kuchlari va AQSh armiyasiga qarshi harakatlari juda muvaffaqiyatli bo'ldi, chunki 2000 yil o'rtalaridan boshlab Afg'onistondan "Xoqani tarmog'i" haqida eslatila boshlandi, bu esa bu lashkarboshining ta'siri kuchayganligini ko'rsatmoqda. 2006 yildan beri Xoqoniy bilan birga uning o'g'li Sirajuddin (Siraj) tarmoqni boshqargan. 2007 yildan beri Siraj otasining sog'lig'i yomonlashgani sababli guruhni boshqargan. Tolibon bilan chambarchas bog'liq bo'lgan "Haqqoniy" terroristik guruhi baribir mustaqil faoliyat yuritgan va hech qachon hech kimga bo'ysunmagan.
Ko'p o'tmay, "Haqqani Network" rahbariyati tarkibiga uning asoschisi oilasining bir nechta a'zolari va bir qator dala qo'mondonlari kiritilgan edi, guruh Afg'onistonning bir necha viloyatlarini nazorat qilar edi. 2008 yildan beri guruh terroristik hujumlarni amalga oshirish uchun xudkush bombalardan foydalanishni boshladi, AQSh ma'murlari buni Afg'onistondagi Amerika qo'shinlari uchun eng katta tahdid deb bilishni boshladilar. Maxfiy xizmatlarning ma'lumotlariga ko'ra, 2010 yilda tarmoq a'zolari soni 4 dan 15 ming kishiga qadar bo'lgan. Guruh yopiq bo'lganligi sababli jangarilar sonini aniqroq aniqlash qiyin edi.
2008 yildan beri guruh asoschisi Siraj Xoqanining o'g'li AQSh tomonidan terrorchilar ro'yxatiga kiritilgan, 2009 yildan buyon u haqida ma'lumot uchun 5 million dollar mukofot e'lon qilingan. Keyingi yillarda Nosiruddin Haqqoniy, Xalil al-Rahmon Xoqoniy va Badruddin Haqqoniy terrorchilar ro'yxatiga qo'shildi.
Uzoq vaqt davomida AQSh rasmiylari "Haqqoniy tarmog'ini" rasmiy ravishda terroristik guruhlar qatoriga kiritishga jur'at etolmadilar, chunki ular hanuzgacha bunday nufuzli harakat rahbarlari bilan kelishuvga erishishga umid qilishgan. Mamlakat razvedka xizmati hattoki tarmoq vakillari bilan uchrashuvlar o'tkazgan, ammo ular hech qanday kelishuvga erisha olmagan.
Vaziyat nihoyat 2011 yil sentyabr oyida, Haqqoniy tarmog'ining terrorchilari NATO kuchlari shtab-kvartirasi va AQShning Kobuldagi elchixonasiga hujum qilganida aniqlandi. 16 kishi hujum qurboniga aylandi. Terroristlar bilan kelishuvga erishishning iloji bo'lmasligi ayon bo'ldi va 2012 yil sentyabr oyida Qo'shma Shtatlar Haqqoniy tarmog'ini terroristik guruhlar ro'yxatiga qo'shgani e'lon qilindi.
